山東大學第二醫院起步區新院區位于起步區崔寨片區，黃河大道以西，萃清路以東，中心大街以南，總建筑面積約18.23萬平方米，其中地下建筑面積6.32萬平方米，地上建筑面積11.4萬平方米，結構形式為框剪結構；地下2層（局部夾層），地上裙樓5層，塔樓12層；檐口高度 51.35米，為一類高層公共建筑（醫療建筑）。

起步區新院凸顯以人為本、高效節能的設計理念。山大二院起步區新院以“國際先進、國內領先”為標準，按照1000床三級甲等綜合醫院標準建設，包括急診急救中心、門診、綜合診療中心、感染性疾病科、病房樓等工程。